A Escola São Luiz Gonzaga funciona em um prédio situado na Rua Avenida Pelotas, nº 355, esquina com a rua Marcílio Dias, no bairro Cidade Nova, no município do Rio Grande/RS.
  O prédio tem 18 salas de aula, 01 secretaria, 01 sala de direção, 01 laboratório de informática, 02 almoxarifados, 01 biblioteca, 02 salas de coordenação, 01 sala de professores, 21 banheiros, 01 laboratório de ciências, 01 salão/teatro, 01 praça, 02 pátios descobertos, 01 ginásio, 01 cantina, 01 sala de recursos, 01 sala de vídeo e 01 saleta de atendimento psicológico.
   As 18 salas de aula são distribuídas entre a Educação Infantil e o Ensino Fundamental. Todas as salas possuem janelas amplas, iluminação e ventilação. A Educação Infantil tem 07 salas de aula utilizadas somente para este nível de ensino. Todas estas salas contêm uma bancada para materiais e brinquedos, mesas coletivas e cadeiras de acordo com o número de crianças de cada turma, sendo estes móveis do tamanho adequado para as crianças. Cada sala tem brinquedos, jogos e livros direcionados a faixa etária da turma e ao número de crianças, além de colchonetes para permitir mobilidade nas atividades e brincadeiras de chão. Uma das seis salas da Educação Infantil possui banheiro anexo, sendo elas ocupadas pelas turmas com crianças menores.
   O Ensino Fundamental possui 11 salas de aula, partilhadas entre Anos Iniciais e Anos Finais nos respectivos turnos de cada nível. Cada sala possui 01 classe e 01 cadeira para cada estudante, dispostas em grupos de até cinco componentes, uma mesa e cadeira de professor, um armário e 01 quadro. As salas de aula ocupadas pelos Anos Finais possuem um projetor. Duas das onze salas possuem banheiro anexo e são geralmente ocupadas pelas turmas de 1º ano. Os materiais, brinquedos e livros de cada sala, variam de acordo com o ano da turma que a ocupa.
   Pela manhã até 2019, nove das onze salas são ocupadas com as turmas de 5º ao 9º ano. À tarde, todas as salas são ocupadas pelas turmas de 1º ao 4º ano. A ocupação das salas varia de acordo com o número de turmas do ano letivo.